Re: ERROR: out of memory

On 06/11/2012 09:48 PM, "Stéphane A. Schildknecht" wrote:
> -----BEGIN PGP SIGNED MESSAGE-----
> Hash: SHA1
>
> Le 11/06/2012 11:03, Annie Gendrault a écrit :
>> Bonjour,
>>
>> Nous avons une base de données en version 8.4.5 dans laquelle nous
>> stockons, dans un attribut de type texte, des séquences génomiques.
>>
>> Malheureusement nous rencontrons un pb pour l'une des séquences dont la
>> taille est de 1,1Gb
>>
>> l'erreur obtenue lors de l'insert dans la base est la suivante :
>>
>> DBD::Pg::db do failed: ERROR: out of memory DETAIL: Cannot enlarge
>> string buffer containing 0 bytes by 1111995493 more bytes. at
>> /projet/.......
>
>> Dans mon fichier postgresql.conf shared_buffers = 8192MB
> C'est élevé.
> Quelle version de PostgreSQL utilisez-vous ?
> De combien de RAM dispose votre serveur ?

La version est la 8.4.5 comme je l'ai dit dans le message
et le serveur a 32G de RAM...

>> Sinon postgresql crée bien une table toast... Mais en regardant la doc
>> concernant Toast j'ai trouvé ceci:
>>
>> "TOAST récupère deux bits du mot contenant la longueur d'un varlena
>> ..............limitant du coup la taille logique de toute valeur d'un type
>> de données TOAST à 1 Go"
>>
>> Ma question : Y-a-t-il une réelle limite quelque part à 1 Gb ??
>
> La taille d'un champ est effectivement limitée à 1GB.
>
>
> - --
> Stéphane Schildknecht
> http://www.Loxodata.com
> Contact régional PostgreSQL
> http://bistri.me/sas
>
> -----BEGIN PGP SIGNATURE-----
> Version: GnuPG v1.4.11 (GNU/Linux)
> Comment: Using GnuPG with Mozilla - http://enigmail.mozdev.org/
>
> iEYEARECAAYFAk/WS38ACgkQA+REPKWGI0Hr9ACfW3kyE2h2oDCNsaLpCgN+ByWj
> xhcAoNHkx5gk4CAmevsXipRgXncqqv3H
> =VhIj
> -----END PGP SIGNATURE-----

--
Annie Gendrault
INRA - Unité Mathématique, Informatique et Génome
78352 Jouy-en Josas cedex
Tel: 01 34 65 28 98
Fax: 01 34 65 29 01
Email: annie(dot)gendrault(at)jouy(dot)inra(dot)fr
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